Флора национального парка насчитывает свыше 700 видов. В травяном покрове хвойных лесов преобладают кислица, черника или вейник, им сопутствуют майник двулистный, грушанка круглолистная,седмичник европейский, брусника и др., в широколиственных и хвойно-широколиственных лесах — осока волосистая, зеленчук, сныть или пролесник, звездчатка жестколистная, обычны медуница, ветреницалютиковая, гусиный лук, купена многоцветковая, аконит и др. На болотах среди чахлых сосен и сфагновыхмхов растут пушица влагалищная и осока топяная, багульник, кассандра, голубика, клюква, росянка идругие болотные растения.
В Лосином Острове обычны ландыш, купальница, встречаются хохлатка плотная,волчье лыко, касатик жёлтый, любки двулистная и зеленоватая, пальчатокоренник Фукса и другие особоохраняемые в Москве и Московской области виды растений. Ссылка
- Багульник болотный
- Ветреница лютиковая
- Волчье лыко обыкновенное
- Горец змеиный
- Двулепестник альпийский
- Дремлик широколистный
- Ирис желтый
- Калужница болотная
- Кокушник длиннорогий
- Колокольчик крапиволистный
- Колокольчик персиколистный
- Кубышка желтая
- Кувшинка белая
- Купальница европейская
- Ландыш майский
- Любка зеленоцветковая
- Любка двулистная
- Можжевельник обыкновенный
- Монция ручейная
- Мятлик расставленный
- Незабудка лесная
- Орхидея — гудайера ползучая
- Подъельник обыкновенный
- Страусник обыкновенный
- Фиалка топяная
- Хохлатка плотная
